Za podporo okoljskim znanstvenikom pri iskanju "primernega" modela sistema, ki ga preiskujejo, je potreben računalniški program, ki uporabnikom omogoča izvajanje simulacij z uporabo različnih modelov, oceno prepoznavnosti in oceno vrednosti parametrov modela (z uporabo izmerjenih podatkov) in za oceno negotovosti napovedi.Računalniški program AQUASIM je bil razvit za izvajanje takšnih analiz tehničnih in naravnih vodnih sistemov.AQUASIM svojim uporabnikom omogoča, da opredelijo prostorsko konfiguracijo sistema, ki ga je treba raziskati, kot niz predelkov, ki se lahko med seboj povežejo s povezavami.Trenutno razpoložljivi tipi oddelkov vključujejo mešane reaktorje, biofilmske reaktorje (sestavljene iz biofilma in faze v razsutem stanju), advektivno-difuzne reaktorje (vtični reaktorji z disperzijo ali brez nje), nasičene stolpce tal (s sorpcijsko in izmenjavo volumenske pora),rečni odseki (opisujejo vodni tok in transport snovi in ​​transformacijo v odprtih kanalih) in jezera (opisujejo stratifikacijo in transport snovi in ​​transformacijo v vodnem stolpcu jezera in v sosednjih plasteh usedlin).Predelke je mogoče povezati z dvema vrstama povezav (jezera še ni mogoče povezati z drugimi predelki).Advetivne povezave predstavljajo pretok vode in transport advektivnih snovi med oddelki, vključno z bifurkacijami in križišči.Difuzne povezave predstavljajo mejne plasti ali membrane, v katere lahko nekatere snovi selektivno prodrejo.Uporabnik programa lahko prosto določi nabor spremenljivk stanja in procesov transformacije, ki naj bodo aktivni v oddelkih.Za model, kot ga je določil uporabnik, lahko program izvaja simulacije, analize občutljivosti in ocene parametrov z uporabo izmerjenih podatkov.Te funkcije naredijo program zelo koristno raziskovalno orodje.Izračunane rezultate je mogoče prikazati na zaslonu (samo različica okenskega vmesnika), zapisati v datoteko Post-Script za prenos na tiskalnik ......