Cytoscape je odprtokodna programska platforma za vizualizacijo kompleksnih omrežij in njihovo integracijo s katero koli vrsto atributskih podatkov.Na voljo je veliko vtičnikov za različne vrste problematičnih področij, vključno z bioinformatiko, analizo družbenih omrežij in semantičnim spletom.Cytoscape podpira številne primere uporabe v molekularni in sistemski biologiji, genomiki in proteomiki: naložite nabore podatkov o molekularnih in genetskih interakcijah v različnih oblikah. Projektirajte in integrirajte globalne naloge podatkov in funkcionalne opombe. Vzpostavite močne vizualne preslikave teh podatkov. Izvedite napredno analizo in modeliranje s pomočjo vtičnikov Cytoscape Vizualizirajtein analizira nabore podatkov, ki jih pripravi človek, kot sta Reactome ali KEGG.