DiffPDF lahko primerja dve datoteki PDF.Ponuja dva načina primerjave: besedilo in videz.Privzeto je primerjava besedila na vsakem paru strani, podprta pa je tudi primerjava videza strani (na primer, če je spremenjen diagram ali če se odstavek preoblikuje).Mogoče je tudi primerjati določene strani ali obsege strani.Na primer, če obstajata dve različici datoteke PDF, ena s stranmi 1-12 in druga s stranmi 1-13, ker je dodana dodatna stran kot stran 4, jih lahko primerjate tako, da določite dve obsegi strani, 1-12 za prvo in 1-3, 5-13 za drugega.Tako bo DiffPDF primerjal strani v parih (1, 1), (2, 2), (3, 3), (4, 5), (5, 6) in tako naprej, da (12, 13)....