0
DNAssist
DNAssist ponuja intuitiven en sam vmesnik, v katerem se datoteke zaporedja prikazujejo, urejajo in analizirajo.Uporabnik lahko prilagodi zaslon v oknih urejevalnika tako, da izbere pisavo, velikost pisave in dolžino vrstice.Zaporedje analiziramo tako, da preprosto pripišemo okno urejevalnika na vrh in v meniju izberemo potrebno analizo.Vse analize se lahko izvedejo tudi na izbranem območju zaporedja v oknu urejevalnika.Z desnim klikom miške bo prikazan kontekstno občutljiv pojavni meni.Tako uporabniku ponuja priročno bližnjico do večine elementov v meniju.Analize, ki so na voljo na DNAssist, vključujejo: Pretvoritev zaporedja DNK med krožnimi in linearnimi oblikami Pretvorba DNK v RNA ali proteinsko sekvenco Pretvorba RNA v DNK ali beljakovinsko zaporedje Prevajanje DNK zaporedja v zaporedje aminokislinv enem, treh ali vseh šestih okvirih Iskanje odprtih bralnih okvirov (ORF-ov) v zaporedju DNK Iskanje določenih vzorcev zaporedja v zaporedju (to omogoča nadomestne znake, neusklajenosti in vrzeli) Izvedba restriktivne encimske analize z definiranim naborom encimov Izvajanje promotorja DNAanaliza z določenimi faktorji transkripcije Lociranje močnih signalov za pozicioniranje nukleozomov v DNK Izvajanje več poravnav DNA, RNA ali beljakovin Pridobitev molekulske mase nukleinske kisline ali proteina Pridobitev temperature taljenja oligonukleotida Izračun pI proteina Izračun hidrofilnega, hidrofobnega oz.antigeni profil proteina Pridobitev molskega absorpcijskega koeficienta in E0,1% nukleinskih acijevd ali beljakovine Pridobivanje nukleotidne ali aminokislinske sestave nukleinske kisline ali proteina DNAssist združuje vse te lastnosti v eno dobro integrirano aplikacijo za Windows.Rezultat analize je prikazan v oknu z rezultati in ga je mogoče natisniti, shraniti na disk ali kopirati in prilepiti v aplikacije drugih proizvajalcev.Shranjeni ali kopirani rezultati ohranijo obliko, v katerem so bili prikazani ....
Spletna stran:
https://github.com/mcychan/DNAssist/wikiKategorije
Alternativa DNAssistu za vse platforme s katero koli licenco
7
Genome Compiler
Genome Compiler je enostavna platforma za genetsko zasnovo, ki raziskovalcem omogoča manipulacijo in oblikovanje vsega, od posameznih genov do celotnih genomov.